Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms