Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms