Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms