Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PRAMEF10O60809 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF10O60809 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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