Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms