Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLX3O43711 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms