Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms