Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBDO15205 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms