Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TO15178 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TO15178 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TO15178 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TO15178 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TO15178 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TO15178 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TO15178 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TO15178 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TO15178 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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