Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
U2SURPO15042 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2SURPO15042 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms