Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QRK9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QRK9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QRK9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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