Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms