Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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