Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HELTA6NFD8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms