Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX8Q9Y5X2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms