Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms