Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED3Q9Y3Q3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms