Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF1Q9Y375 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF1Q9Y375 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms