Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP3Q9Y2W7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms