Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms