Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO4Q9UKT5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO4Q9UKT5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms