Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP25Q9UHP3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP25Q9UHP3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms