Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF4Q9P032 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms