Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC59Q9P031 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms