Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MSRB1Q9NZV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MSRB1Q9NZV6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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