Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD3Q9NY59 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms