Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIC8BQ9NVN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms