Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVAQ9NVD7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PARVAQ9NVD7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVAQ9NVD7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms