Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD2Q9NV79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms