Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNIP2Q9NS61 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms