Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF1Q9HCE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms