Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC2Q9HCC0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC2Q9HCC0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms