Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POPDC3Q9HBV1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POPDC3Q9HBV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POPDC3Q9HBV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POPDC3Q9HBV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POPDC3Q9HBV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POPDC3Q9HBV1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms