Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPCSQ9HAB8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPCSQ9HAB8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms