Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP1Q9H902 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP1Q9H902 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms