Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAIP1Q9H074 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAIP1Q9H074 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAIP1Q9H074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms