Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL4Q9C0H6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms