Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM31Q9BZY9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM31Q9BZY9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM31Q9BZY9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM31Q9BZY9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM31Q9BZY9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM31Q9BZY9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM31Q9BZY9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM31Q9BZY9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms