Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TM6SF1Q9BZW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM6SF1Q9BZW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM6SF1Q9BZW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM6SF1Q9BZW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TM6SF1Q9BZW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM6SF1Q9BZW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
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