Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM8Q9BZR9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms