Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALN1Q9BXU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALN1Q9BXU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALN1Q9BXU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms