Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA4Q9BXL8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDCA4Q9BXL8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms