Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REPIN1Q9BWE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REPIN1Q9BWE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
REPIN1Q9BWE0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms