Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB2BQ9BVA1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB2BQ9BVA1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms