Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKNK1Q9BUB5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MKNK1Q9BUB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MKNK1Q9BUB5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MKNK1Q9BUB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms