Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 ZNF398-204ENST00000485111 609 ntTSL 415.46■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 215.36■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SMARCD2-211ENST00000584483 821 ntTSL 215.3■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MUTYH-223ENST00000479746 971 ntTSL 315.14■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 CCDC130-211ENST00000589669 701 ntTSL 215.12■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.017e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 515□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MUTYH-224ENST00000481139 1051 ntTSL 214.86□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHH1-207ENST00000558981 2146 ntTSL 214.68□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WASHC3-212ENST00000544341 945 ntTSL 314.65□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 314.62□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 314.59□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 TRMT44-207ENST00000531038 541 ntTSL 314.56□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 RALGDS-209ENST00000471109 636 ntTSL 314.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-12■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-221ENST00000477203 3122 ntTSL 214.32□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MAP2K3-205ENST00000477540 927 ntTSL 214.25□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ACD-208ENST00000602656 714 ntTSL 214.24□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MUTYH-218ENST00000470256 839 ntTSL 314.06□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-12■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 CCHCR1-215ENST00000488920 715 ntTSL 313.87□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHH1-202ENST00000557971 5555 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 L3MBTL2-207ENST00000479978 5875 ntTSL 213.64□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PAAF1-214ENST00000544552 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ARMC9-204ENST00000436339 626 ntTSL 313.58□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WASH2P-201ENST00000453662 1684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZBTB17-204ENST00000444358 722 ntTSL 513.45□□□□□ -0.265e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MTMR14-211ENST00000449543 773 ntTSL 313.45□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-12■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 EIF3D-209ENST00000462641 887 ntTSL 213.12□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MUTYH-238ENST00000533178 1225 ntTSL 513.05□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 RECQL4-203ENST00000529424 324 ntTSL 213.01□□□□□ -0.334e-24■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 L3MBTL2-206ENST00000466589 3055 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SMG6-206ENST00000570668 547 ntTSL 412.68□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 CCHCR1-212ENST00000475684 786 ntTSL 512.56□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WASHC3-203ENST00000500685 588 ntTSL 312.55□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PAAF1-210ENST00000541951 1383 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SPTLC2-205ENST00000556607 460 ntTSL 312.32□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WASHC3-202ENST00000326351 843 ntTSL 212.23□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MAN2B2-204ENST00000505907 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.21□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 REC8-212ENST00000619469 2720 ntTSL 212.21□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHH1-216ENST00000561456 595 ntTSL 412.14□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZZEF1-209ENST00000573606 865 ntTSL 212.06□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MUTYH-221ENST00000476789 932 ntTSL 212.03□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SEPT7-218ENST00000635420 581 ntTSL 311.99□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 511.94□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PAAF1-216ENST00000546039 805 ntTSL 311.76□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 FLVCR2-213ENST00000556856 1020 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 NUP188-204ENST00000467044 584 ntTSL 211.63□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHH1-206ENST00000558386 3383 ntTSL 211.53□□□□□ -0.568e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 TRMT44-204ENST00000511366 4157 ntTSL 211.43□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ARMC9-208ENST00000467698 541 ntTSL 511.35□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 JAK1-202ENST00000465376 814 ntTSL 311.31□□□□□ -0.68e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 TRMT44-203ENST00000511149 508 ntTSL 411.13□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SEPT7-212ENST00000634591 740 ntTSL 510.99□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 L3MBTL2-201ENST00000216237 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 REC8-202ENST00000558191 561 ntTSL 410.93□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SLC9A8-203ENST00000489787 492 ntTSL 310.91□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WASHC3-209ENST00000540536 883 ntTSL 310.58□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 TERB2-202ENST00000557864 775 ntTSL 310.38□□□□□ -0.751e-12■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SHARPIN-210ENST00000534435 656 ntTSL 210.33□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZNF107-202ENST00000360117 1061 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 TERB2-203ENST00000559137 796 ntTSL 510.2□□□□□ -0.781e-12■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SMG6-210ENST00000572205 551 ntTSL 49.91□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SMG6-216ENST00000575176 557 ntTSL 49.91□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZBTB17-211ENST00000487785 401 ntTSL 29.65□□□□□ -0.865e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 FLVCR2-212ENST00000556745 575 ntTSL 39.54□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 L3MBTL2-204ENST00000452106 3282 ntTSL 29.47□□□□□ -0.894e-6■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ARMC9-202ENST00000424740 582 ntTSL 29.35□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 XPNPEP1-212ENST00000475123 440 ntTSL 29.18□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 TTLL5-203ENST00000554132 182 ntTSL 39.17□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 32.7
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 5525.8 ms