Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF6BQ99941 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATF6BQ99941 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms