Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A1Q99808 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A1Q99808 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A1Q99808 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms