Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1Q99720 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms