Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIM3Q96PE6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM3Q96PE6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIM3Q96PE6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms